Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 LSM4YER112W 564 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YGL138CYGL138C 1038 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 CFD1YIL003W 882 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YLR169WYLR169W 354 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YBL065WYBL065W 345 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 TYE7YOR344C 876 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 SLS1YLR139C 1932 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 VPS53YJL029C 2469 nt3.46□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YAT2YER024W 2772 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 MPC3YGR243W 441 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 EPT1YHR123W 1176 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 HIS5YIL116W 1158 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 DLS1YJL065C 504 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YAL064WYAL064W 285 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 COX19YLL018C-A 297 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 CSM3YMR048W 954 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 SHH3YMR118C 591 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 FMP41YNL168C 780 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 MRPL17YNL252C 846 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 ITT1YML068W 1395 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 RTG3YBL103C 1461 nt3.45□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 ARP9YMR033W 1404 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 BMS1YPL217C 3552 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 SSU1YPL092W 1377 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 PET100YDR079W 336 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 VMA8YEL051W 771 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 MAG1YER142C 891 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YGL117WYGL117W 798 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 SCM4YGR049W 564 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YIL161WYIL161W 708 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 RPC37YKR025W 849 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 ENV10YLR065C 546 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 UNG1YML021C 1080 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 SAM37YMR060C 984 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 snR11snR11 258 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 CTP1YBR291C 900 nt3.44□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YDL176WYDL176W 2127 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 TAO3YIL129C 7131 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YCR100CYCR100C 951 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YGR064WYGR064W 369 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YGR114CYGR114C 390 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 PTI1YGR156W 1278 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 ECM13YBL043W 774 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 FIG1YBR040W 897 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YBR116CYBR116C 528 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 TFB2YPL122C 1542 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 MAK11YKL021C 1407 nt3.43□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 RRM3YHR031C 2172 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 PUF6YDR496C 1971 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YDL157CYDL157C 357 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YPR1YDR368W 939 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 USE1YGL098W 738 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 TDA10YGR205W 873 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 DOG1YHR044C 741 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 GLG2YJL137C 1143 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 EMC2YJR088C 879 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 MOH1YBL049W 417 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 OSW1YOR255W 837 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 HUL5YGL141W 2733 nt3.42□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 SPP382YLR424W 2127 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 HSE1YHL002W 1359 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 PSK1YAL017W 4071 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 MIX14YDR031W 366 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 ERG25YGR060W 930 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 RFA3YJL173C 369 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YKR070WYKR070W 1059 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 GTT2YLL060C 702 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 YNL226WYNL226W 411 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 HAT1YPL001W 1125 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 PDC2YDR081C 2778 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 ROD1YOR018W 2514 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 TRS120YDR407C 3870 nt3.41□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 AI4Q0065 1671 nt3.4□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 VPS30YPL120W 1674 nt3.4□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 UBP5YER144C 2418 nt3.4□□□□□ -1.86
HSP42Q12329 TRX3YCR083W 384 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 RRP42YDL111C 798 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 FOL2YGR267C 732 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 RPL22AYLR061W 366 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 YML096WYML096W 1578 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 YNL184CYNL184C 327 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 YNL319WYNL319W 441 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 BTS1YPL069C 1008 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 PRM4YPL156C 855 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 COM2YER130C 1332 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 SAD1YFR005C 1347 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 KAP104YBR017C 2757 nt3.4□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 ECM18YDR125C 1362 nt3.39□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 SPT14YPL175W 1359 nt3.39□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 HFD1YMR110C 1599 nt3.39□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 BMH2YDR099W 822 nt3.39□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 YDR193WYDR193W 399 nt3.39□□□□□ -1.87
HSP42Q12329 APA2YDR530C 978 nt3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms