Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YJL016WYJL016W 1686 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 MDV1YJL112W 2145 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 VPH1YOR270C 2523 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 MGR3YMR115W 1506 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 PFA5YDR459C 1125 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 SAS2YMR127C 1017 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 ATP3YBR039W 936 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 VPS72YDR485C 2388 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 KIN82YCR091W 2163 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 TCP1YDR212W 1680 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 YEL043WYEL043W 2871 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 TRM13YOL125W 1431 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 STT4YLR305C 5703 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 MSH3YCR092C 3057 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 YGL132WYGL132W 336 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 YJL147CYJL147C 1149 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 YDR131CYDR131C 1671 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 APL4YPR029C 2499 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 MGT1YDL200C 567 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 YLR365WYLR365W 333 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 IDI1YPL117C 867 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 DBP7YKR024C 2229 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 NDT80YHR124W 1884 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR3Q12316 CAT8YMR280C 4302 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 NUF2YOL069W 1356 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 YBR197CYBR197C 654 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 CUS1YMR240C 1311 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 YDR431WYDR431W 312 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 SLH1YGR271W 5904 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 YGR126WYGR126W 693 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 COA6YMR244C-A 315 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 SPS4YOR313C 1017 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 RPC40YPR110C 1008 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 MAK21YDR060W 3078 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 ZDS2YML109W 2829 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 MSH6YDR097C 3729 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 BOS1YLR078C 735 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 STU1YBL034C 4542 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 TTI1YKL033W 3117 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 REH1YLR387C 1299 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 RCE1YMR274C 948 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 SAS4YDR181C 1446 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 ELO3YLR372W 1038 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 ADI1YMR009W 540 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 STH1YIL126W 4080 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 YCR013CYCR013C 648 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 CYC1YJR048W 330 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 ALY1YKR021W 2748 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 MDS3YGL197W 4464 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 DOT6YER088C 2013 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1B-GR3Q12316 TDA3YHR009C 1572 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 BRR6YGL247W 594 nt2.84□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 TOF1YNL273W 3717 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 MIX14YDR031W 366 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 PET191YJR034W 327 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 YMR310CYMR310C 954 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 BSD2YBR290W 966 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 RGA1YOR127W 3024 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 MMS1YPR164W 4224 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 SMP1YBR182C 1359 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 ESC1YMR219W 4977 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 YLR326WYLR326W 723 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 PEX17YNL214W 600 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 SEN54YPL083C 1404 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 MIH1YMR036C 1665 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 NFI1YOR156C 2181 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 CBP1YJL209W 1965 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 STF2YGR008C 255 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 ALO1YML086C 1581 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 SLD7YOR060C 774 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 TPD3YAL016W 1908 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 EXO84YBR102C 2262 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 TIF35YDR429C 825 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 GUK1YDR454C 564 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 MEI5YPL121C 669 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 SET1YHR119W 3243 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 MIF2YKL089W 1650 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 TFC1YBR123C 1950 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 SAC3YDR159W 3906 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 DIT1YDR403W 1611 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 JSN1YJR091C 3276 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 YDR089WYDR089W 2610 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 COS4YFL062W 1140 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 SET6YPL165C 1122 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 BCS1YDR375C 1371 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1B-GR3Q12316 PSK1YAL017W 4071 nt2.78□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 GIS1YDR096W 2685 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 JID1YPR061C 906 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 LYS9YNR050C 1341 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 YRB1YDR002W 606 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 VAM10YOR068C 345 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 POS5YPL188W 1245 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 ADK2YER170W 678 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 TWF1YGR080W 999 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 ARF3YOR094W 552 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 GRR1YJR090C 3456 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 GLO3YER122C 1482 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1B-GR3Q12316 SLX8YER116C 825 nt2.74□□□□□ -1.97
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