Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 NSE3YDR288W 912 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 HUL5YGL141W 2733 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 YGR107WYGR107W 450 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 DAL2YIR029W 1032 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 CYR1YJL005W 6081 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 EMC2YJR088C 879 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 NDL1YLR254C 570 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 REC102YLR329W 795 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 RAD10YML095C 633 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 HRT1YOL133W 366 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 PFY1YOR122C 381 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 CAT5YOR125C 702 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 YSA1YBR111C 696 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.55□□□□□ -2
USB1Q12208 HEH2YDR458C 1992 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 YIL169CYIL169C 2988 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 AI2Q0055 2565 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 snR63snR63 255 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 PHD1YKL043W 1101 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 YAL069WYAL069W 315 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 HRT3YLR097C 1035 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 ATP11YNL315C 957 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 RPL20BYOR312C 519 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 SUR1YPL057C 1149 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 GYL1YMR192W 2163 nt2.54□□□□□ -2
USB1Q12208 ADY4YLR227C 1482 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 TAF2YCR042C 4224 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 TLC1TLC1 1301 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 YDL032WYDL032W 312 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 LRS4YDR439W 1044 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 DOG1YHR044C 741 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 YLL037WYLL037W 381 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 SDO1YLR022C 753 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 YLR444CYLR444C 303 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 SEC14YMR079W 915 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 SYC1YOR179C 567 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 YOR263CYOR263C 408 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 POS5YPL188W 1245 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 RED1YLR263W 2484 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 RAX2YLR084C 3663 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 PMR1YGL167C 2853 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 FAA2YER015W 2235 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 NMD2YHR077C 3270 nt2.53□□□□□ -2
USB1Q12208 ROG1YGL144C 2058 nt2.53□□□□□ -2.01
USB1Q12208 DUN1YDL101C 1542 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 TPO5YKL174C 1857 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MOT1YPL082C 5604 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 JSN1YJR091C 3276 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 ECM18YDR125C 1362 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 STE24YJR117W 1362 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 ERP3YDL018C 678 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 DBP10YDL031W 2988 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 THO1YER063W 657 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 CFD1YIL003W 882 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 NIT3YLR351C 876 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 RPN13YLR421C 471 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SMA2YML066C 1110 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YOR062CYOR062C 807 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MCA1YOR197W 1299 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SPS4YOR313C 1017 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YPR203WYPR203W 309 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 snR34snR34 203 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YCK2YNL154C 1641 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YML096WYML096W 1578 nt2.52□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SLI1YGR212W 1407 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SKT5YBL061C 2091 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 ECM29YHL030W 5607 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 PSY2YNL201C 2577 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 PMI40YER003C 1290 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SCL1YGL011C 759 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YAR075WYAR075W 474 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 TEM1YML064C 738 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 AAR2YBL074C 1068 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 DDI3YNL335W 678 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 PFK27YOL136C 1194 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 DIM1YPL266W 957 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 SRP68YPL243W 1800 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YME2YMR302C 2553 nt2.51□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MRH1YDR033W 963 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 HTA1YDR225W 399 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 EPT1YHR123W 1176 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 REX3YLR107W 1215 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 COA4YLR218C 453 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 BLS1YLR408C 369 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YPL107WYPL107W 747 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 RPL33AYPL143W 324 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YPR050CYPR050C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YBR116CYBR116C 528 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 ARA1YBR149W 1035 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 GCD6YDR211W 2139 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 EAP1YKL204W 1899 nt2.5□□□□□ -2.01
USB1Q12208 FLO11YIR019C 4104 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 DSE4YNR067C 3354 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 ILS1YBL076C 3219 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 MED2YDL005C 1296 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 YDL050CYDL050C 372 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 FIN1YDR130C 876 nt2.49□□□□□ -2.01
USB1Q12208 RMD5YDR255C 1266 nt2.49□□□□□ -2.01
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