Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 PNT1YOR266W 1272 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YSP2YDR326C 4317 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 RPN1YHR027C 2982 nt3.14□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 MET5YJR137C 4329 nt3.13□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 STE11YLR362W 2154 nt3.13□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YML037CYML037C 1023 nt3.13□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YET2YMR040W 483 nt3.13□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 DUF1YOL087C 3351 nt3.13□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 PSK1YAL017W 4071 nt3.13□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 DYN1YKR054C 12279 nt3.12□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 RSM24YDR175C 960 nt3.12□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 TAF4YMR005W 1167 nt3.12□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.12□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 XRN1YGL173C 4587 nt3.12□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 PAF1YBR279W 1338 nt3.12□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 VPS33YLR396C 2076 nt3.12□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 GPP2YER062C 753 nt3.11□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YPT35YHR105W 645 nt3.11□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 MRPS17YMR188C 714 nt3.11□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 RPL33AYPL143W 324 nt3.11□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 MSB2YGR014W 3921 nt3.11□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 UBP1YDL122W 2430 nt3.11□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YKR015CYKR015C 1707 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 MAL12YGR292W 1755 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 MAL32YBR299W 1755 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 RSM26YJR101W 801 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 SWD2YKL018W 990 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 SSN8YNL025C 972 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YNL184CYNL184C 327 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YOL050CYOL050C 321 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 YOR263CYOR263C 408 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 MRPL37YBR268W 318 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 DSS1YMR287C 2910 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 NMD2YHR077C 3270 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 SAS4YDR181C 1446 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 NEW1YPL226W 3591 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 CHS2YBR038W 2892 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 CWH41YGL027C 2502 nt3.1□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 TFB2YPL122C 1542 nt3.09□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 DRS2YAL026C 4068 nt3.09□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 RPB9YGL070C 369 nt3.09□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 PEF1YGR058W 1008 nt3.09□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 REX3YLR107W 1215 nt3.09□□□□□ -1.91
TY3A-GQ12173 DUN1YDL101C 1542 nt3.09□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 FKS3YMR306W 5358 nt3.08□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 snR57snR57 88 nt3.08□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 PRE1YER012W 597 nt3.08□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 SCM4YGR049W 564 nt3.08□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 SDH3YKL141W 597 nt3.08□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 EXO84YBR102C 2262 nt3.08□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 MTL1YGR023W 1656 nt3.08□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YDR186CYDR186C 2634 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 DOA4YDR069C 2781 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
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TY3A-GQ12173 YER138CYER138C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YER160CYER160C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
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TY3A-GQ12173 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
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TY3A-GQ12173 YML039WYML039W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YML045WYML045W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YMR050CYMR050C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
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TY3A-GQ12173 MPS2YGL075C 1164 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 PHD1YKL043W 1101 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 ENV10YLR065C 546 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YLR339CYLR339C 552 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 SPC24YMR117C 642 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 SUR1YPL057C 1149 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YML096WYML096W 1578 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 SPO71YDR104C 3738 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 FAR1YJL157C 2493 nt3.07□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 PDC2YDR081C 2778 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 SOK1YDR006C 2706 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 ECM18YDR125C 1362 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YDR442WYDR442W 393 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 HUL5YGL141W 2733 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 RIX1YHR197W 2292 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YIL025CYIL025C 375 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 AAH1YNL141W 1044 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YBL081WYBL081W 1107 nt3.06□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 SPP382YLR424W 2127 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 COM2YER130C 1332 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YIL175WYIL175W 318 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 GLG2YJL137C 1143 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 YNL109WYNL109W 546 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 CIK1YMR198W 1785 nt3.05□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 AST2YER101C 1293 nt3.04□□□□□ -1.92
TY3A-GQ12173 EDC1YGL222C 528 nt3.04□□□□□ -1.92
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