Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 GLG2YJL137C 1143 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 IME1YJR094C 1083 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ERV41YML067C 1059 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ECM13YBL043W 774 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 TAF3YPL011C 1062 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PBP2YBR233W 1242 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YGR237CYGR237C 2358 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 VPS9YML097C 1356 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PKP2YGL059W 1476 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 FAP7YDL166C 594 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RGI1YER067W 486 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 CUP1-1YHR053C 186 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 CUP1-2YHR055C 186 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPF2YKR081C 1035 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 COQ9YLR201C 783 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YLR416CYLR416C 399 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 snR11snR11 258 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 NOP4YPL043W 2058 nt3.37□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 WHI3YNL197C 1986 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YDL242WYDL242W 354 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 CDC26YFR036W 375 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 COX23YHR116W 456 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPS7AYOR096W 573 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 AME1YBR211C 975 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 APA1YCL050C 966 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 SPH1YLR313C 1593 nt3.36□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YMR018WYMR018W 1545 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 NKP1YDR383C 717 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YGL117WYGL117W 798 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YGR111WYGR111W 1203 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YJL175WYJL175W 513 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YLR198CYLR198C 360 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RAD33YML011C 534 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 HHF1YBR009C 312 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 POL30YBR088C 777 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 snR44snR44 211 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 CTP1YBR291C 900 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 HRD1YOL013C 1656 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 DSE1YER124C 1722 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 MDM10YAL010C 1482 nt3.35□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 DUN1YDL101C 1542 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PSF1YDR013W 627 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 GRX2YDR513W 432 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YGL214WYGL214W 486 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPS23AYGR118W 438 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YBL028CYBL028C 321 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 MRPL17YNL252C 846 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PEX15YOL044W 1152 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 SAS5YOR213C 747 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPS23BYPR132W 438 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YMR317WYMR317W 3423 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ERG9YHR190W 1335 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 CHS3YBR023C 3498 nt3.34□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 SLY41YOR307C 1362 nt3.34□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 SMC2YFR031C 3513 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 VPS17YOR132W 1656 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 MPS2YGL075C 1164 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 FSH1YHR049W 732 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 OST6YML019W 999 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 TRI1YMR233W 681 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YNR062CYNR062C 984 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 DNM1YLL001W 2274 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ART10YLR392C 1557 nt3.33□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YDL176WYDL176W 2127 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 HTA1YDR225W 399 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 APA2YDR530C 978 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 LSM4YER112W 564 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 SCM4YGR049W 564 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YHR180WYHR180W 492 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 DLS1YJL065C 504 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 RPS28BYLR264W 204 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 DIA1YMR316W 1011 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 GIS2YNL255C 462 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 GRX7YBR014C 612 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 snR42snR42 351 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ARO4YBR249C 1113 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 MET10YFR030W 3108 nt3.32□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 RRP5YMR229C 5190 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 AUS1YOR011W 4185 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 GCD2YGR083C 1956 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 ARF1YDL192W 546 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 PET100YDR079W 336 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 SMT3YDR510W 306 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 PUG1YER185W 912 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 RPL30YGL030W 318 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YIR040CYIR040C 333 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YMR087WYMR087W 855 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 MRPL16YBL038W 699 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 SEC27YGL137W 2670 nt3.31□□□□□ -1.88
VPS54Q12071 YEL025CYEL025C 3567 nt3.31□□□□□ -1.88
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