Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYCNQ0VAF6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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