Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL2Q08999 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL2Q08999 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL2Q08999 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL2Q08999 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL2Q08999 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL2Q08999 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL2Q08999 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL2Q08999 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms