Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FMODQ06828 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FMODQ06828 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FMODQ06828 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FMODQ06828 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms