Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 ROG1YGL144C 2058 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 KIN82YCR091W 2163 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 ARF1YDL192W 546 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 FIN1YDR130C 876 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 CFD1YIL003W 882 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 TEM1YML064C 738 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YBL081WYBL081W 1107 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YBL094CYBL094C 333 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 PIN3YPR154W 648 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 SEC27YGL137W 2670 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 GWT1YJL091C 1473 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 GYL1YMR192W 2163 nt2.7□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 TRA1YHR099W 11235 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 GEA1YJR031C 4227 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 MMS1YPR164W 4224 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YGR073CYGR073C 372 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 MPD2YOL088C 834 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 ECM18YDR125C 1362 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 FKH2YNL068C 2589 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 ECM21YBL101C 3354 nt2.69□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 TLC1TLC1 1301 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 BNI4YNL233W 2679 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 RGR1YLR071C 3249 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 NSA2YER126C 786 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 PEF1YGR058W 1008 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 RPL14BYHL001W 417 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 SDS3YIL084C 984 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 GTT2YLL060C 702 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 SMA2YML066C 1110 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YNL203CYNL203C 612 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YNR062CYNR062C 984 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YML096WYML096W 1578 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 PSY2YNL201C 2577 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 AXL1YPR122W 3627 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 VAC14YLR386W 2643 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YKL222CYKL222C 2118 nt2.68□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 HFM1YGL251C 3564 nt2.67□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 BNR1YIL159W 4128 nt2.67□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 RRP42YDL111C 798 nt2.67□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YAL069WYAL069W 315 nt2.67□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YBL028CYBL028C 321 nt2.67□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 MET16YPR167C 786 nt2.67□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 DUN1YDL101C 1542 nt2.67□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 PPH3YDR075W 927 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 RPB9YGL070C 369 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YJR128WYJR128W 360 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 MRPL16YBL038W 699 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YOL050CYOL050C 321 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 INO4YOL108C 456 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 APD1YBR151W 951 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 NUM1YDR150W 8247 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YER138CYER138C 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YER160CYER160C 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YJR027WYJR027W 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YML039WYML039W 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YML045WYML045W 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YMR050CYMR050C 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 RDS2YPL133C 1341 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 JSN1YJR091C 3276 nt2.66□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YDL050CYDL050C 372 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 PCL2YDL127W 927 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 HPA3YEL066W 540 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 YGR107WYGR107W 450 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 SPO16YHR153C 597 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 MRPL38YKL170W 417 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 COS1YNL336W 1146 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 ARA1YBR149W 1035 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 UTP14YML093W 2700 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 PLM2YDR501W 1566 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 SRO77YBL106C 3033 nt2.65□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 VHR2YER064C 1518 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 TAN1YGL232W 870 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 YHR097CYHR097C 1101 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 DAD2YKR083C 402 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.64□□□□□ -1.99
YMR226CQ05016 YNL043CYNL043C 321 nt2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms