Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XPCQ01831 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XPCQ01831 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
XPCQ01831 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XPCQ01831 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
XPCQ01831 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
XPCQ01831 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XPCQ01831 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
XPCQ01831 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XPCQ01831 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XPCQ01831 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XPCQ01831 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XPCQ01831 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPCQ01831 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPCQ01831 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPCQ01831 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPCQ01831 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPCQ01831 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPCQ01831 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XPCQ01831 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
XPCQ01831 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XPCQ01831 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms