Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms