Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTBN1Q01082 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms