Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD3P62318 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms