Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD1P62314 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms