Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMO4P61968 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMO4P61968 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMO4P61968 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMO4P61968 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMO4P61968 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMO4P61968 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMO4P61968 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms