Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms