Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CABP4P57796 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP4P57796 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CABP4P57796 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABP4P57796 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABP4P57796 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CABP4P57796 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CABP4P57796 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CABP4P57796 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CABP4P57796 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CABP4P57796 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CABP4P57796 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABP4P57796 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CABP4P57796 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CABP4P57796 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms