Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMDP57764 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms