Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP107P57740 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP107P57740 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP107P57740 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP107P57740 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms