Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP4P57723 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCBP4P57723 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms