Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK1P57059 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK1P57059 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK1P57059 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK1P57059 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK1P57059 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK1P57059 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK1P57059 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK1P57059 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK1P57059 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK1P57059 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK1P57059 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK1P57059 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK1P57059 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK1P57059 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK1P57059 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms