Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN8P56748 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN8P56748 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms