Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTBP2P56545 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms