Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL23P55773 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL23P55773 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL23P55773 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL23P55773 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL23P55773 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms