Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP7P55210 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP7P55210 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP7P55210 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP7P55210 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP7P55210 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP7P55210 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CASP7P55210 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASP7P55210 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP7P55210 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP7P55210 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP7P55210 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP7P55210 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP7P55210 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP7P55210 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP7P55210 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP7P55210 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP7P55210 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP7P55210 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP7P55210 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP7P55210 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP7P55210 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP7P55210 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP7P55210 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP7P55210 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP7P55210 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms