Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHBP55084 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HADHBP55084 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HADHBP55084 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HADHBP55084 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HADHBP55084 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HADHBP55084 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms