Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATMP50440 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATMP50440 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GATMP50440 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATMP50440 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATMP50440 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATMP50440 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATMP50440 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATMP50440 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATMP50440 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATMP50440 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATMP50440 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms