Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP153P49790 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP153P49790 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP153P49790 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP153P49790 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP153P49790 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP153P49790 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP153P49790 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP153P49790 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP153P49790 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP153P49790 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP153P49790 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP153P49790 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP153P49790 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP153P49790 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NUP153P49790 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP153P49790 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP153P49790 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP153P49790 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP153P49790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms