Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES1P49788 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms