Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP4P49662 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP4P49662 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP4P49662 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP4P49662 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP4P49662 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP4P49662 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP4P49662 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP4P49662 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP4P49662 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP4P49662 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP4P49662 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP4P49662 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP4P49662 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms