Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI2P48788 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI2P48788 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms