Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJA8P48165 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJA8P48165 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJA8P48165 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJA8P48165 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJA8P48165 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJA8P48165 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA8P48165 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA8P48165 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA8P48165 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA8P48165 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA8P48165 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms