Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSFP46459 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSFP46459 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSFP46459 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSFP46459 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSFP46459 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSFP46459 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NSFP46459 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSFP46459 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSFP46459 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSFP46459 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSFP46459 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSFP46459 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSFP46459 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms