Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPHP41219 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPHP41219 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPHP41219 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPHP41219 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPHP41219 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPHP41219 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPHP41219 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPHP41219 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPHP41219 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPHP41219 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPHP41219 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPHP41219 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms