Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX5P35711 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX5P35711 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX5P35711 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX5P35711 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX5P35711 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX5P35711 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX5P35711 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX5P35711 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX5P35711 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX5P35711 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX5P35711 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms