Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP1P32455 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP1P32455 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP1P32455 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP1P32455 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP1P32455 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP1P32455 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms