Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms