Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLIP1P30622 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLIP1P30622 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CLIP1P30622 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLIP1P30622 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLIP1P30622 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLIP1P30622 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLIP1P30622 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLIP1P30622 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLIP1P30622 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CLIP1P30622 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CLIP1P30622 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CLIP1P30622 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLIP1P30622 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms