Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSPOP30536 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSPOP30536 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSPOP30536 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSPOP30536 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSPOP30536 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms