Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID4AP29374 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID4AP29374 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms