Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.818e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.848e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-213ENST00000551962 578 ntTSL 59.46□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-204ENST00000548281 554 ntTSL 49.37□□□□□ -0.918e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 LNP1-202ENST00000466996 1723 ntTSL 59.25□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ATE1-204ENST00000423243 2031 ntTSL 1 (best)8.93□□□□□ -0.986e-9■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ARMC8-204ENST00000461822 2221 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.028e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ARMC8-218ENST00000485396 1920 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-216ENST00000552848 537 ntTSL 58.55□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ARMC8-215ENST00000471453 2910 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.068e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 CCDC15-203ENST00000529051 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 LNP1-203ENST00000489752 1813 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.098e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 48.18□□□□□ -1.18e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-212ENST00000551779 1462 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.198e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-203ENST00000548076 367 ntTSL 57.6□□□□□ -1.198e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-211ENST00000551412 548 ntTSL 27.47□□□□□ -1.218e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 RPTOR-204ENST00000572733 424 ntTSL 37.18□□□□□ -1.268e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 27.1□□□□□ -1.278e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.298e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-208ENST00000550027 553 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.388e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 IMMT-211ENST00000490238 699 ntTSL 46.31□□□□□ -1.46e-11■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.428e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.428e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ASAP1-212ENST00000521426 566 ntTSL 45.42□□□□□ -1.548e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ASAP1-209ENST00000520927 742 ntTSL 55.14□□□□□ -1.598e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.618e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ARMC8-205ENST00000463485 1059 ntTSL 34.92□□□□□ -1.628e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ARMC8-216ENST00000471709 691 ntTSL 33.7□□□□□ -1.828e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ATE1-206ENST00000481784 326 ntTSL 51.64□□□□□ -2.156e-9■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 31.38□□□□□ -2.191e-14■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 HIVEP2-205ENST00000474532 258 ntTSL 54.75□□□□□ -1.651e-7■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 BTBD19-209ENST00000495433 934 ntTSL 318.48■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 BTBD19-204ENST00000464114 505 ntTSL 317.17■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 STRIP2-203ENST00000465033 587 ntTSL 37.15□□□□□ -1.267e-10■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 HNRNPM-210ENST00000598367 298 ntTSL 56.81□□□□□ -1.321e-9■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 32.43□□□□□ -2.021e-9■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 DYRK3-205ENST00000489878 1772 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.082e-13■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 SLC35B1-217ENST00000513508 631 ntTSL 27.8□□□□□ -1.161e-13■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.197e-7■■■■■ 37.7
PTBP1P26599 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.514e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 54.4□□□□□ -1.714e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.348e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.418e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.488e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-214ENST00000638917 2306 ntTSL 511.52□□□□□ -0.578e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-221ENST00000640081 2385 ntTSL 511.45□□□□□ -0.588e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.658e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-205ENST00000638184 1330 ntTSL 58.9□□□□□ -0.988e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-226ENST00000640790 1249 ntTSL 57.83□□□□□ -1.168e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.248e-10■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.654e-13■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 KXD1-208ENST00000597438 635 ntTSL 39.1□□□□□ -0.954e-13■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 KXD1-206ENST00000596244 341 ntTSL 37.25□□□□□ -1.254e-13■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 TASP1-203ENST00000455532 1000 ntTSL 57.06□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 TYW1B-202ENST00000612372 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 MYO9A-216ENST00000567560 4056 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.583e-8■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.713e-8■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 PTRH2-201ENST00000393038 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 PTRH2-202ENST00000409433 2246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 PTRH2-204ENST00000579915 531 ntTSL 43.65□□□□□ -1.832e-7■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 PTRH2-205ENST00000587935 409 ntTSL 32.06□□□□□ -2.082e-7■■■■■ 37.6
PTBP1P26599 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.116e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 519.88■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.436e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.326e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 315.77■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.846e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 38.44□□□□□ -1.066e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ZNF653-205ENST00000590548 2016 ntTSL 222.48■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ITGB1BP2-202ENST00000465388 888 ntTSL 310.13□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ADD1-219ENST00000514940 1332 ntTSL 510.01□□□□□ -0.814e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ADD1-221ENST00000536078 423 ntTSL 29.1□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 AMMECR1L-202ENST00000393001 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 ITGB1BP2-205ENST00000538820 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.044e-8■■■■■ 37.5
PTBP1P26599 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 37.5
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 110.8 ms