Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMGB2P26583 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms