Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms