Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRDP23468 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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