Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA4P22459 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA4P22459 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms