Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCL3P20749 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCL3P20749 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCL3P20749 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BCL3P20749 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCL3P20749 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCL3P20749 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms