Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFE3P19532 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFE3P19532 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFE3P19532 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFE3P19532 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFE3P19532 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFE3P19532 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFE3P19532 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFE3P19532 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms