Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2F2P13984 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2F2P13984 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms