Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TOP2AP11388 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms