Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1P11387 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1P11387 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1P11387 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1P11387 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1P11387 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1P11387 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms